После охраняемых ворот, следует тоннель, протяжённостью 5 миль, под названием «Южный тоннель Чёрной Мезы», ведущий во внутрь комплекса, находящийся рядом с грузовым складом. В конце тоннеля есть надпись «Южный проход».
Конец внутренней части тоннеля можно увидеть в игре [I]Blue Shift[/I] в начале главы «[I]Захваченный груз[/I]», а конец наружной части тоннеля в самом начале и конце главы «[I]Освобождение[/I]».
Когда Барни Калхаун достигает грузового склада, он замечает, что переключатель ворот, открывающий доступ к тоннелю был повреждён солдатами HECU, тем самым, мешая кому-либо пройти через них.
Позже, после того, как Барни открывает портал в секции A-17 «Лаборатории прототипов» для Розенберга, Беннета и Симмонса, отправляющий на поверхность к другому концу тоннеля, Розенберг и Симмонс подготавливают внедорожник, который в дальнейшем будет использоваться, чтобы покинуть комплекс. В это время, Беннет ломает ворота монтировкой. Когда приходит очередь Барни пройти через портал, он попадает в «какое-то резонансное смещение», и не в состоянии добраться до тоннеля сразу. Сперва он попадает обратно в Зен, а затем оказывается в маленькой подсобке, где видит, как два солдата HECU тащут Гордона Фримена, находящегося без сознания, на промышленную территорию сектора E. В конце-концов, Барни оказывается рядом с учёными, они покидают комплекс навсегда, и их дальнейшая судьба неизвестна.
